答案：

    （1）计算转让土地应纳的各种税

    1、甲企业应纳契税的计算：

    转让土地使用权时补交的土地出让金应纳契税=1 500×5%=75（万元）

    2、营业税的计算：

    转让土地应纳营业税=2 000×5%）=100（万元）

    3、城建税和教育费附加的计算：

    应纳城建税和教育费附加=100×（7%+3%）=10（万元）

    4、印花税的计算：

    根据有关规定，土地使用权的出让和转让书据均不贴印花税。

    5、土地增值税的计算：

    转让土地的收入=2 000万元

    扣除项目金额的计算：

    取得土地使用权时支付的金额=1 500+75=1 575（万元）

    土地开发成本=100万元

    土地开发费用=（1 575+100）×5%+5=88.75（万元）

    允许扣除的税金=100+10=110（万元）

    扣除项目金额合计=1 575+100+88.75+110=1 873.75（万元）

    转让土地的增值额=2 000-1 873.75=126.25（万元）

    增值额占扣除项目金额的比重=126.25÷1873.75×100%≈6.7%

    应纳土地增值税=126.25×30%=37.875(万元)

    (2)计算交换厂房交纳的各种税：

    1、交换厂房应纳契税，但是因为交换双方的不动产价值相等，所以免征契税。

    2、应纳营业税500×5%=25（万元）

    3、应纳城建税和教育费附加=25×（7%+3%）=2.5（万元）

    4、应纳印花税=（500+500）×5‰=0.5（万元）

    5、应纳土地增值税的计算：

    收入=500万元

    扣除项目金额的计算：

    评估价格=800×30%=240（万元）

    评估费=0.3（万元）

    交易手续费=0.15（万元）

    允许扣除的税金=25+2.5+0.5=28（万元）

    扣除项目金额合计=240+0.3+0.15+28=268.45（万元）

    增值额=500-268.45=231.55（万元）

    增值额占扣除项目金额的比重=231.55÷268.45×100%≈86.25%

    应纳土地增值税=231.55×40%-268.45×5%≈79.20(万元)